オンサイトにお菓子はありますか

お菓子買ってきました
左後ろにあります

「これは、i 回目の操作では aXi と aYi を入れ替えることを表す。」ではなく、
「これは、i 回目の操作では Xi と Yi を入れ替えることを表す。」ではないか？

いえ、前者で正しいです。

しかし正確には「これは、i 回目の操作では aXi と aYi の値を入れ替えることを表す。」と書くべきでした。修正します。

距離が近いとありますが，距離は最短距離で定められますか

はい

出力例1間違ってませんか

確かにその通りです。1行目の出力を4ではなく3とすれば正しくなると思います。修正します。

この処理は停止しますか？

yes

Tの中の文字を置換するとそれはSにも反映されますか。

されます。